黄瓜常见的虫害之一是根结线虫。它主要危害黄瓜的根部。受到害后，黄瓜的根部发育不良，侧根增多，并在根尖处形成大小不一的球状或圆锥状的瘤。这些瘤最初呈白色且质地松软，后变为褐色或暗褐色，表面有时会龟裂。被害植株的地上部分生长不良，叶子变黄，早晨时候出现萎蔫枯死的情况，有时会被误认为是枯萎病引起的。防治该虫害的方法是进行土壤消毒。在种植前，可以使用1.8%浓度的虫螨克乳油按每平方米1-1.5毫升兑水6升进行土壤消毒。在生长期间，可以每隔10-15天使用1.8%浓度的虫螨克乳油1,000-1,500倍液进行1-2次的根部灌溉。
另一种常见的黄瓜虫害是白粉虱。白粉虱的食性很广，可以危害多种蔬菜。它主要以幼虫为害，喜欢聚集在黄瓜的叶背面吸取汁液，导致叶片褪色、变黄、萎蔫，严重的情况下会导致植株死亡。它还会分泌黏液，污染叶片，引起霉菌感染，影响黄瓜植株的光合作用，严重影响产量和品质。预防和控制白粉虱的方法包括避免混栽，特别是黄瓜、西红柿和菜豆不应该混植在一起。老龄幼虫主要分布在下部叶片，可以摘除老叶并进行销毁。可以使用25%噻嗪酮（扑虱灵）可湿性粉剂，或者使用2.5%溴氰菊酯或20%氰戊菊酯（速灭杀丁）乳油2000倍液进行喷雾处理，每隔6-7天进行一次，连续防治3次。还可以使用烟雾剂进行熏蒸处理，连续进行2-3次。
